В статье рассматриваются актуальные вопросы обучения младших школьников, имеющих трудности, на основе психолого-педагогического анализа научной литературы. Обсуждаются теоретические подходы к характеристике дефиниции «трудности в обучении» как дидактического явления. Раскрываются внутренние и внешние причины, которые приводят к расхождению между системными учебными требованиями начального общего образования и индивидуальным интеллектуальным потенциалом учащегося. Новизна заключается в построении типологии трудностей в обучении детей младшего школьного возраста и обосновании инструментария комплексной психолого-педагогической поддержки с учетом ресурсов развития когнитивных процессов. Предложенная систематизация психолого-педагогических условий и организационно-методических принципов профилактики трудностей в обучении в начальной школе могут быть полезны для педагогов, психологов, родителей.