У пяти различных исследованных особей Equus ferus caballus выявлены довольно сходные микробиомы профили кишечника вне зависимости от типа питания, физиологического статуса, возраста, пола и пород. Метагеномное секвенирование (MiSeq, «Illumina, Inc.», США) осуществляли с набором MiSeq Reagent Kit v3 («Illumina, Inc.», США). В составе микробиома прямой кишки обследованных особей E. ferus caballus было выявлено 25 филумов микроорганизмов. Был выявлен ряд микроорганизмов, которые могут сопутствовать возникновению различных заболеваний: колик, ацидозов, ламинитов и пр. Например, во всех образцах содержимого прямой кишки были обнаружены нежелательные представители отряда Lactobacillales, такие как Streptococcus equinus и Str. bovis, которых связывают с возникновением ацидозов и ламинитов лошадей.