Статья: МЕТОД МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА В РАЗРАБОТКЕ НОВЫХ АНАЛОГОВ ПРОГЕСТЕРОНА

Целью работы стало проведение молекулярного докинга гестагенных препаратов и родственных им соединений к рецептору прогестерона человека изоформы А и оценка использования этого метода для поиска высокоактивных прогестинов. С помощью программы Autodock 4.2 был проведен молекулярный докинг прогестерона, а также родственных ему 13 соединений, в разных степенях проявляющие гестагенную/антиге-
стагенную активность (мегестрола ацетат, Амол, бутират Амола, медроксипрогестерон-17-ацетат, левоноргестрел, 6α-метил-16α,17α-циклогексанопрогестерон, 16α,17α-циклопентанопрогестерон, 16α,17α-циклогексанопрогестерон, пролигестон, 16α,17α-циклогекс-3’- енопрогестерон, идрогестерон, ифепристон, улипристала ацетат). Расчеты теоретических констант диссоциации комплексов лиганд–рецептор прогестерона показали, что с помощью программы Autodock 4.2 на ранних этапах исследования можно оценивать вероятность активности того или иного соединения-кандидата, но делать это необходимо с осторожностью, принимая во внимание отсутствие связи констант диссоциации с гестагенной активностью аналогов прогестерона. Кроме того, метод позволяет выявить соединения, которые при взаимодействии с рецептором прогестерона меняют положение его аминокислотных остатков в лиганд-связывающем домене (возможно имеют другой механизм действия), а также вещества, которые не взаимодействуют с агонистической формой рецептора вследствие других причин.